m6A 甲基化测序
m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)
是真核生物mRNA最常见的一种转录后修饰
占到RNA甲基化修饰的80%。已知绝大部分真核生物中
mRNA在5’Cap处存在的甲基化修饰,作用包括维持mRNA稳定性
mRNA前体剪切、多腺苷酸化、mRNA运输与翻译起始等
而3’polyA发生的甲基化修饰有助于出核转运
翻译起始以及与polyA结合蛋白一起维持mRNA的结构稳定
目前,在全转录组范围检测m6A修饰的主流技术是MeRIP-seq(m6A-seq)
该技术使用N6-甲基腺嘌呤抗体富集高甲基化的RNA片段
然后结合高通量测序,在全转录组范围检测m6A修饰。